HNC thông quan theo thông tư 100/2010/TT BTC về chuyển phát nhanh đường hàng không, Thông tư 36/2011/TT BTC về thông quan chuyển phát nhanh đường bộ. Hiện HNC đang thực hiện thông quan cho đối tác OCS của Nhật, SF Express của Trung Quốc, Hanjin của Hàn Quốc, Sagawa của Nhật mảng vận tải đường bộ qua cửa khẩu Mộc Bài – Tây Ninh.
